因为拿到小精灵就像找王灵挑战的小茂被爷爷告知今一早王灵就离开了，虽然不甘心但是也无可奈何。向真新镇的居民道别之后，坐在一辆红色的跑车中离开了。
“什么嘛，有什么了不起。”小智看到小茂离开的方向显得非常的不甘心。
“这不是小智吗？”正巧大木博士来到大门口，见到站在外面的小智。
“大木博士，我的小精灵呢？”小智见到大木博士立即到博士的跟前。
“你的小精灵？”
“嗯，我的小精灵。”
“说的也是，他们告诉有今天预定的有四个人。小智，你不会想要穿睡衣去修行吧？”大木博士看到穿着睡衣的小智说道。
“这跟穿衣服没有太大的关系吧……总之不管是什么快点给我小精灵吧！”说着小智的脸都快要贴到大木博士的身上了。
“跟我进来吧。”
大木博士带着小智来到了研究所内，看见的是呈三角形，上面刻着名字的精灵球。
“我想了好久，终于做好了决定。杰尼龟，我的小精灵已经决定是你了！”小智打开之后却发现是空的。
“啊？”
“这个已经被没有迟到的人拿走了。”一旁的大木博士说道。
“算我不对不该迟到，这样的话，那就要妙蛙种子了。”
这还是空的。
“这个也被准时过来的人拿走了。”
“小火龙……怎么会？！”
“搭车就跟小精灵样子，迟到一秒就可以改变人生的。”
“那我要两人空空的去旅行吗？”小智看向大木博士。
“是还有一只，可是……”大木博士面露难色。
“那就给我那只好了。”
“这个被挑剩下的小精灵是有点问题的。”大木博士看着手中的小精灵说道。
“反正我会迟到也是因为我有问题嘛。”
“那就给你了。”大木博士听到后将精灵球交给了小智。
而小智也得到了命运中的伙伴，皮卡丘！
“对了，大木博士，怎么没有看见小灵哥哥和樱花姐姐啊，我记得他们是借住在你这里的。”小智东张西望了半天都没有看见王灵的身影。
“他们今天一早就离开了，只是留了一张纸条说明了一下。”
小智听到后有些失望，他还以为可以见到王灵呢。
出来的时候花子带着亲友团在等着小智了，而小智被电了两次，身体还是麻麻的。
花子已经将小智的旅行用品准备好了，同时也看见了小智身边的皮卡丘，这让花子想到了王灵送给她的玻璃工艺品中小智肩上的皮卡丘。
“是巧合吧。”花子心道。
小智的旅行花子身为母亲可是非常不放心的，将所有的事情都对小智嘱咐了一遍。
接着在被皮卡丘集体电了一次之后，小智踏上了旅程。
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