邓飞第一次随非凡采访是到宁乡暗访假冒卫生巾厂，虽对大学生而言这个话题有些尴尬，但他热情投入暗访。非凡还指导邓飞做专题报道，特别是“医疗意外”系列报道，引起湖南省卫生厅、长沙市卫生局重视，相关部门负责人接受采访，呼吁医务工作者少出一些“医疗意外”，也希望患者及患者家属能够宽容一些“医疗意外”。
后来由于非凡岗位变动，便将邓飞交转其他记者，由其他记者指导他的实习工作。
2000年下半年，邓飞正式进入女报担任记者。他曾卧底调查黑心商贩用福尔马林保鲜食品事件并报道，引起社会强烈关注，从此走上调查记者之路。
后来，邓飞在《凤凰周刊》工作十年，成为首席记者，发表《南中国贩童链》《周庄肺病》等有影响力的调查报道，成为中国调查记者领军人物。
然而，中国调查记者面临诸多困境，尤其是潜伏、暗访时，要面对生命危险，可能遭遇恐吓、暗算、追杀、辞退等。每次成功报道都是“暴露”，增加生命风险。这种高压环境让很多人望而却步或中途退出。
后来，邓飞退出调查记者队伍，投身公益事业。他发起和推动免费午餐、微博打拐、大病医保、暖流计划、儿童防侵、让候鸟飞、中国水安全计划等公益项目，并提出“柔软改变中国”理念，强调用温和、理性方式推动社会进步，坚信公益力量能改变社会。
邓飞，已然成为我国公益领域的杰出人士。
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